試管嬰兒與自然受孕不同，試管嬰兒整個操作過程都在醫生的把控當中，因此也讓一些人認為，透過試管嬰兒技術能夠挑選胎兒的性別，想生男孩就能生男孩，想生女孩就能生女孩。
但事實上並非如此，雖然現在的第三代試管技術確實可以知道胚胎的性別，但是國內試管嬰兒三代技術僅用於疾病篩查，檢測的目的是排查遺傳病和基因疾病，而並非單純的性別篩選，更不能人為進行性別選擇。在除規定特殊情況之外的性別選擇是違法行為。
因此，在國內做試管嬰兒肯定不能保證生男孩，但是如果是做第三代試管可以選擇性別，有一個前提條件，就是有一定要選擇性別才能生出健康的孩子。
如今種植前遺傳學確診和判斷的研究可對胚胎進行性別確診和判斷，是透過特殊的方法對體外受精後4-10細胞階段的胚胎活檢1-2個細胞進行分析。關鍵是用在防止性連鎖遺傳病的患兒妊娠，防止了高危夫妻在發現胎兒異常後需要終止妊娠的痛苦。
三代試管嬰兒如何在技術上實現保證生男孩
試管嬰兒技術分為一二三代，只有第三代試管嬰兒技術具備篩選男孩女孩的能力，三代試管嬰兒技術又稱胚胎植入前遺傳學診斷技術，從字面意思理解，就是在胚胎移植入女方子宮前進行基因篩查就能判斷出性別，這項技術誕生初始是為了幫助有遺傳病以及染色體有問題的家庭生育出健康的寶寶，在胚胎階段就對有問題的基因、染色體進行阻斷，是一項非常先進、有益的技術，後面這項技術也被廣泛應用於篩查胎兒性別，從技術上實現了試管嬰兒能保證生男孩。
因此，很多本身就有性別選擇傾向的人就會產生做試管生男孩或女孩的想法。但是在國內只有符合以下條件的才能在正規生殖中心做三代。
首先夫妻雙方必須已經結婚登記，能夠開具準生證，並且滿足以下三個條件的其中一個或多個。
（1）夫妻雙方或者其中一方患有會傳染給後代的遺傳病；
（2）夫妻雙方或者其中一方染色體存在問題；
（3）女方之前多次流產或者多次試管嬰兒失敗（兩次以上）
如果滿足這些條件，那麼帶好戶口本以及結婚證、準生證、相關檢查報告就可以去醫院建檔做三代試管嬰兒了。那麼此時是不是可以保證生男孩了呢，非也，沒那麼簡單。
在國內能夠篩選性別的原因只有一種：醫學需要，有些基因、染色體問題“傳男不傳女”或者“傳女不傳男”，此時為了患者能夠生育出健康後代，醫生會在胚胎培育階段分析胎兒性別並移植健康胚胎到女方子宮內，這種篩選是因為醫學需要和優生優育，並非傳統意義上的挑選性別，醫生只能根據基因、染色體問題特性選擇合適性別的胚胎移植，並不能保證生男孩（有些遺傳病只會傳給男性後代，女性後代不會遺傳）。
那去國外做試管嬰兒可以保證生男孩嗎？國外的一些國家在法律上確實相對寬鬆，準父母可以根據自己的性別意願挑選胚胎然進行移植。
因為歷史及傳統等因素，國內很多家庭都有強烈的生男孩意願，不生個男孩誓不罷休，這些夫妻能夠正常生育，俄羅斯等國成了海外試管嬰兒熱門選擇。
