早在開播前，就有網友爆料這部劇被刪減了十多集，原本40集直接被刪到28集。
原版高賀並不是高明遠和賀雲的兒子，而是王政和賀雲的私生子，這也是賀云為什麼能平步青雲的原因，因為有省委常委在支援她。但王政的私生子必須被隱藏，所以高明遠就認高h為義子。
第二，裴偉在前期埋下了大量伏筆，但在正式版中被刪的一點不剩，前文已經暗示的很明顯，他也是內鬼之一，正片卻直接被剪沒了，在二十四集抓捕廚子之後很突兀的沒有他戲份直接消失了。其實裴偉是王政的人，並且和王有大量戲份，在原版抓捕廚子後直接就被拷上了手銬，最後也被繩之以法。
第三，麥佳原本有更多的戲份，他存在的目的主要是為了引出王喜好美女高明遠圈養了更多美女，投其所好的故事。但在現版全部刪除。
掃黑風暴的縮減導致有點高開低走，很多人物與情節先得碎片化。本來一開始故事所設計就是希望把幾個社會反應強烈的案件揉在一起，希望透過14年前的麥自立案件串聯起來，引出涉黑案件。由於涉及幾個大案，裡面的演員也眾多。這種“大劇”本來應該比較長篇才能把所有的事情都充分串聯，而且給演員們的展現也能夠充分。但是刪減帶來的效果確實不好。
王政的設定完全就被刪沒了，你看王政一出場滿臉都是戲，老戲骨也沒發揮餘地呀。最終BOSS才是關鍵呀，咋沒戲份呢？顯然是稽核不過，估計是怕影響形象。不過，這就有點過了，《人民的名義》裡面還有副國級人物，雖然不露臉，高育良政法委書記和省公安廳的角色位置也不低。這個刪除真顯得莫名其妙。
高明遠角色的弱化，其實如果王政戲份多的話，高明遠弱化是對的，畢竟不是大BOSS。但是王政戲份刪除了之後，高明遠就顯得沒那麼“深不可測”了。一開始滅口薛梅看DV，抱著麥佳還覺得此人可怕。結果後面埋區長還被人發現，而且用的董耀，炮王個個都是拖油瓶，顯得這人也沒那麼“有智慧”。高明遠在王政戲份刪除後就頂著第一反派的角色，但是角色設定頂不起終極大反派的格局。
零碎的中間人角色設定。調查組兄妹，感覺也是可有可無，妹妹引出大江的感情戲。哥哥串聯成陽和張勇。這樣還不如讓張勇直接和成陽聯手還比較直接。派出所小弟，作用是舉報所長，其實可以讓林浩去調查比較好，可以引出更多情節。混沌店老闆娘，完全跑龍套，不知道有啥用，唯一的熱點就是大家覺得和孫紅雷老婆長得像。美麗貸臥底女警察，這個角色和黃希是重複的，沒有其中一個都可以帶出搗毀美麗貸情節。菜霸的情節，本來抓菜霸以為可以引出14年前的案件，結果啥也沒有，與第一級抓油走私販子明顯對不上，這樣油販子的劇情就又顯得可有可無。
海總的情節部分其實也是可有可無的，重點其實是引出大嫂的股份交易而不是新帥內部的股權紛爭。裴偉是否黑警壓根就沒交代，從情節設定有矛盾，如果是黑警，那麼高速路發現血跡以及二次送檢顯然不會發生好的結果。如果不是黑警，發現薛梅和潑水情節又顯得撲朔迷離。還有就是廚師投毒，這個應該是重要突破口，小人物最容易突破了，就像楊冬。結果一筆帶過，啥事也沒有，顯得非常突兀。鄭毅紅的設定也作用不大，養女如果加大戲份應該是反派二號（例如人民的名義裡面的高小琴），現在顯得又可有可無。其實可以加強和王政的聯絡顯得合理一些，顯示出腐敗的情節串聯。村支書李逵的角色也是屬於可有可無，不知道有啥用。既然涉及到依河新村專案，應該有點作為，例如在調查到村裡面的時候搞點破壞阻攔調查啥的。
所以，我覺得應該加強王政的戲份（類似於高育良），把整個劇情的格局都拉高一些。把他一開始先得深不可測一些或者像高育良的表面清廉，暗地裡加強和高遠明之間的關係與督察組鬥戲。李成陽和何勇CP組合一個在黑道一個在白道配合突破重重阻礙，加上林浩藉著姐弟的死開始死磕所長和賀雲引出背後的關係可能還能精彩點。只有28集，但是引入太多的中間角色，反而拖沓整個劇情。
如果是原本就有40集的話，刪減其實影響了表現力，至少有些劇情可以交代清楚一些。
最後，《掃黑風暴》一開始期望值挺高，但是有點爛尾的意思，草草收場。雖然值得一看，但是原本可以表現得更好，有點可惜。
