晚秋。山林。楓葉或隨清泉流動，或靜靜融入泥土，或飛舞空中，一派寧靜怡人的田園景象，好似王維《山居秋暝》的景象重現。
韓國電影的唯美風格在動畫中展現無遺：鄉間的風光，清新綺麗；飄雪的寺廟，莊嚴素美；雪中的松鼠、畫眉、小花，生意盎然；然而這樣的美景卻是用來描繪一個悲涼的故事。《五歲庵》會讓你聯想到吉卜力高導的《螢火蟲之墓》，天真爛漫的兒童+冰冷的結局+小小的屍體+死後幻想中團聚-最溫暖的一幕。
獲得2004年亞太電影節最佳動畫片獎的本片源自韓國的古老傳說，新羅善德女王時代的梅月大師帶5歲的兒子到一所庵堂修行，因缺少糧食，梅月大師出去化緣，與兒子約好3天后返回。但因風雪阻隔，梅月大師直到第二年的春天才回來，兒子早已坐化在佛像前，庵堂因此更名為五歲庵。
失去父母的姐姐小蘭和五歲的弟弟小吉在海邊欣賞海鷗，然後到溪邊吃著好心婦人送給他們的熱乎乎的土豆，爽朗地笑著。
小吉的願望是找到媽媽。小蘭的願望是再看一次弟弟的臉，她不忍說出媽媽早已葬身火海，也是那場大火奪去了她的雙眼。
兩位僧人遇到困在樹上的小吉和剛剛落水的小蘭，認為這是一種緣分，收留他們在寺中生活。小吉從野貓口中救下的小白狗也一同住進來，取名“微風”，因為在小吉眼中，微風既像姐姐的手一樣柔軟，也像似乎感受得到，但又從來不出現的媽媽。
調皮的小吉總在寺中搗亂，被稱作“小麻煩”：怕鹿冷就偷去僧人的冬衣給它套上、把僧人的鞋子掛在楓樹上玩、弄壞念珠，搞怪花樣層出不窮。
來寺裡的壞孩子欺負姐弟倆，讓小吉感慨為什麼壞孩子都有媽媽疼，而他們沒有。搭救小吉的僧人見他難過，告訴他修行可以開啟心眼，能看到世間萬物，比如微風。小吉認為那就能看到媽媽，所以在初雪過後就隨著僧人到對面的山頂修行。未料到，姐弟的第一次離別也是永久的離別。
山上只有師徒二人，小吉覺得無聊，抓雉雞、抓兔子、求師傅陪他玩。僧人在帶他滑雪的第二天，趁著天好，去集市採購過冬的物品，給小吉買了小冬靴。返回途中，突降大風雪，僧人在山中滑落山谷，昏迷過去，被山裡人救下，但一直髮燒昏迷。
山頂廟中有間屋因曾住過患麻風病的和尚而鎖著，小吉一個人很孤單，見那間房中供奉著觀音的畫像，就來這裡和觀音說話。看著畫像問：可以叫你媽媽嗎？他認為師父是因為他愛惹麻煩，所以生氣了，才好幾天都不回來。
雪化了，僧人病癒和小蘭上山來找小吉，但他已在觀音像前永遠睡著了。姐姐抱著他，畫面切換成粉紅、黃綠的明快溫馨景象。在那裡，媽媽和姐弟快樂的在一起吃飯、嬉戲。為了紀念小吉，懸掛觀音像的房子從此命名為五歲寺。
