公務員現在有職務和職級兩個序列，一至四級主任科員屬於職級系列，而鄉科級正職和鄉科級副職屬於職務序列。職務和職級可以並行，也可以相互轉化，自然有其相同點和不同點。
一至四級主任科員與鄉科級正職、鄉科級副職的相同點有以下幾條：
第一，都屬於科級。其中，一、二級主任科員屬於正科級，三、四級主任科員屬於副科級，而鄉科級正職肯定屬於正科級，鄉科級副職也屬於副科級。
第二，都可以享受相應級別的工資待遇。一、二級主任科員可以享受正科級的工資待遇，同屬正科級的三者工資待遇比較順序如下：一級主任科員>鄉科級正職>二級主任科員。所以，通俗的叫法可以把一級主任科員叫做“大正科”，二級主任科員叫做“小正科”。同樣的，三、四級主任科員可以享受副科級的工資待遇，同屬副科級的三者工資待遇比較順序如下：三級主任科員>鄉科級副職>四級主任科員。所以，通俗的叫法可以把三級主任科員叫做“大副科”，四級主任科員叫做“小副科”。
第三，滿足條件都可以晉升上一級職務或職級，也可以轉任對應的職務或職級。比如，三、四級主任科員任滿兩年可以晉升鄉科級正職，鄉科級副職任滿兩年可以晉升三級主任科員，鄉科級正職任滿兩年可以晉升一級主任科員。四級主任科員可以轉任為鄉科級副職，而鄉科級正職也可以轉任為二級主任科員。
一至四級主任科員與鄉科級正職、鄉科級副職有相同點，自然也有區別，主要由以下幾點：
第一，擔任一至四級主任科員職級公務員只能享受相應級別的工資待遇，不能享受相應級別的政治待遇、工作待遇，而職務公務員卻都享受。比如一級主任科員是正科級，只能享受其對應的工資待遇，不能享受正科級領導職務所能擁有的辦公條件、批閱檔案等等待遇。公務員因公出國出差的交通、住宿標準以及辦公用房標準等待遇，也不以職級掛鉤。
第二，一至四級主任科員職級公務員不承擔領導責任，也不享受領導職權，只需幹好自己的本職工作，而擔任正副科級實職領導職務的，要承擔相應的責任、享受相應的職權，可以管理同級別甚至高級別的職級公務員。
第三，不擔任領導職務的一至四級主任科員的職級公務員一般由所在機關進行日常管理。公務員晉升至所在機關領導成員職務對應的職級，
不作為
該機關領導成員管理。
綜上所述，一至四級主任科員和鄉科級正職、副職有許多相同點，也有不少不同點。一至四級主任科員享受工資待遇，責任更小，晉升更容易，而鄉科級正職和副職承擔領導責任、職權，但壓力大。
