1645年，清軍的鐵騎在攻破嘉定後，即現在的上海市嘉定區，對城內的平民百姓進行了三次屠殺。主要指揮人就是投降清朝的明朝將領李成棟。理由就是百姓不肯剃髮易服，反抗清兵。
明弘光元年（1645年）五月初九，清軍攻破了南京，弘光帝無奈，一路南逃，沒多久，縣令錢默一看抵擋不住清軍，丟下城中百姓，也選擇了出逃。
六月二十四日，清朝的縣令張維熙接管了嘉定，明朝嘉定總兵吳志葵不甘外部勢力侵擾，親率百人，以頭裹白布為標誌，夜間手持火把逼近縣城，揚言要殺了張維熙，由於剛剛到任，各部門還沒有完善，也沒有駐軍，嚇得張維熙連夜逃走。城中百姓夾道歡迎吳志葵。
閏六月初七，明朝降將李成棟收下的騎兵路過新涇橋，獸性大發，凌辱婦女無數，致死7人。隔日，李成棟親率百餘艘戰船，騎兵步兵2000餘人，停泊在縣城東關地區，大肆掠奪財物，凌辱婦女。
十二日，清軍下達了剃髮令，留髮不留頭，留頭不留髮。城中百姓無一不憤慨，誓死不從，組織力量襲擊了李成棟的船隊，一把火燒掉了所有船隻和之前掠奪的財物，並殺掉84名留守的清朝官兵。
十五日，李成棟看城中百姓團結一致抵抗自己，自覺不是對手的他趕忙去太倉求援，行至羅店又被士兵和百姓追殺，李成棟部隊傷亡慘重。於是，李成棟竟喪心病狂的縱容手下濫殺無辜，報復眾人。
十八日，黎明時分，李成棟率兵攻打羅店，城內的支洪，陸文煥率領鄉兵抵抗。李成棟把部隊分成兩部分，一部分從東邊攻打，一部分從西邊攻打。鄉兵不是常年從軍打仗李成棟的對手，腹背受敵，很快敗下陣來，無奈，便退去鎮內防守。正值城內早市，大家都在趕集。
喪心病狂的李成棟率領清軍進行了第一次屠殺，平民死亡1604人。
十九日，黃淳耀，侯峒曾召集大家商議，決定了化整為零，劃地而守的對策。並在城上懸掛了‘嘉定恢剿義師’的大旗，自制了五花八門的各種武器用以抵抗清軍。
二十五日，嘉定總兵吳志葵派遣蔡喬率200餘名士兵支援嘉定，駐守城外。
次日凌晨三點，李成棟部偷襲了蔡喬駐軍，蔡喬戰死。
七月初一，各路鄉兵聚集，匯合了十萬餘人與清兵決戰，清兵兵分兩路，左右夾擊，鄉兵不敵，被追殺者無數。乘勝後的李成棟率兵進入婁塘鎮後，
縱容士兵燒殺搶掠，大肆凌辱婦女，屠殺平民1073人，慘狀無法用言語表達。
七月初三，李成棟與太倉清軍匯合，沒日沒夜炮轟攻城。
初四五日，迎來大雨，因清軍的炮轟，很多房屋被毀，守城計程車兵和百姓居無定所，糧食也消耗殆盡，眾人身心疲憊。此時清軍抓準時機，立即猛攻，從東門攻破之後湧入城內。侯峒曾坐守城樓，二子被殺，自知不敵清軍，便在宣家池（葉池）投水自盡，結果沒有死，隨後被清軍殺害。
大量清軍從東門湧入，城中百姓便向西門逃生，而清兵並不給平民百姓活命的機會，一路圍堵追殺無辜百姓，深知清軍慘無人道的獸行，無數百姓選擇投河自盡。
此時正在鎮守西門的黃淳耀見狀便知東門已經失守，見大勢已去，便與弟弟騎馬到了早年讀書的西林庵，急忙寫下遺書：“遺臣黃淳耀於弘光元年七月初四日自裁於西城僧舍。嗚呼！進不能宣力皇朝，退不能潔身自隱。讀書寡益，學道無成。耿耿不滅，此心而已！異日寇氛復靖，中華士庶再見天日，論其世者，當知予心。”：
大致意思：我於七月初四自殺於西林庵，往前不能效忠皇帝國家，往後不能保住自己的清白，必定會被清軍殺害。讀書沒有得到收穫，學道沒有成績。我心裡一直惦記此事，不能忘記，這心而已！有一天敵人恢復正常了，希望中國人以後再見到我的遺書，根據此時的情況，要知道我的心。”寫完遺書，便和弟弟一起懸樑自盡了。
侯峒曾 黃淳耀
負責南門的守將張錫眉聽聞清軍已經攻打進了城內，便帶著老婆和妾一起投河自盡了。還有守將龔用圓、龔用廣兄弟聽聞城破，也紛紛投河自盡。
清晨7時，李成棟下令開始放炮屠城，挨家挨戶搜查，不放過一間房屋，每見一人，便讓其交出財物，若交得不多，便會連砍三刀，同樣獻出全部財物的百姓，也難免清軍的屠刀。一時間，全城慘叫聲，求饒聲，此起彼伏，血流成河，屍骨成山，仿若人間煉獄。只投河自盡的百姓，就不下數千人。姿色一般的婦女當街砍殺，容貌出眾者，更是當眾被凌辱，若不從，便釘其手足。
七月初六，李成棟把從城內搜刮搶奪來的財物，女子，牲畜裝滿了300餘艘船後，駛往太倉。
七月二十六日，清兵行至葛隆，攻破入鎮後屠城，接連又去了外岡鎮，又屠城。
七月二十七日，喪心病狂的浦嶠、浦嶂率兵再次進入嘉定城內屠城，見人就殺，不分男女老少。
這就是歷史中的‘嘉定三屠’事件
為紀念這次抵抗清兵的明朝將領，在上海嘉定至今還能看到多處紀念侯峒曾和黃淳耀的遺蹟
侯峒曾 黃淳耀紀念碑
上海嘉定城西侯黃橋
西林禪寺
