朱元璋當了皇帝以後，為了鞏固其統治地位，使江山永遠姓朱，殘酷地大肆屠殺功臣。他設立了一個叫做“錦衣衛”的特務機構，專門監視、偵察大臣的活動，特別是那些開國元勳們。大臣不管在家裡還是在外面都逃不過錦衣衛的眼睛，一旦有什麼風吹草動或不正常的行為，就有被打進監獄甚至殺頭的可能。這種做法使大臣們個個膽戰心驚，每天都如履薄冰小心翼翼，甚至上早朝時都愁眉苦臉的和家人告別，如果這一天平安無事，親人們都慶幸他能夠又活著回到家裡。
胡惟庸是朱元璋的左丞相，深受寵信，逐漸權勢日盛，飛揚跋扈，為所欲為。如朝中有人命生死或牽扯官員升降之事，不上報皇帝就自行處理。如果下級官員上奏摺，有不利於自己的事情都藏起來不讓皇帝看到。久而久之，一些善於鑽營及一些失職的武將們都爭先恐後的投入他的門下。公元1380年，丞相胡惟庸被告發叛國謀反，朱元璋立刻把他滿門抄斬，不僅如此，朱元璋還把有胡黨嫌疑的人全部殺了，竟然牽扯到一萬五千多人。
大學士宋濂，是跟朱元璋、劉基一起建立明朝的開國功臣，因為他學識淵博，後來成了太子的老師。但朱元璋並不信任他。有一次，宋濂家裡來了幾個朋友，宋濂就和客人們喝了點酒。第二天上朝時，朱元璋就問，來了幾個客人，備了幾道菜，喝了多少酒，宋濂一一如實回答，朱元璋笑了：“你沒有欺騙我呀！”原來，朱元璋早就安排好錦衣衛注視著他的一舉一動。後來，明太祖朱元璋在朝堂之上表揚宋濂：“宋濂侍候我十九年，從沒說過一句謊言，也沒有說過別人一句壞話，真是個賢人呀！”宋濂六十八歲告老還鄉，朱元璋送給他一幅錦緞，說：“留著他，再過三十二年，做件百歲衣吧！”
胡惟庸案發生以後，有人舉報說宋濂的孫子宋慎也是胡黨，於是牽連到了宋濂。朱元璋立即派錦衣衛把宋濂捉到京城處斬。太子聽說以後，流著眼淚給老師求情，希望父親不要殺他。朱元璋為了開導太子，命人拿來一根滿是棘刺的木棍，放在地上讓太子把它撿起來。太子猶猶豫豫的不去撿它。朱元璋說：“有棘刺的木棍你不敢取，我替你把棘刺削去怎麼樣？”聰明的太子明白了朱元璋的意思，但還是勸說道：“上有堯舜之君，下有堯舜之民。”意思就是有什麼樣的皇上就有什麼樣的臣子，做皇上也不能太殘暴了！氣的朱元璋把太子轟了出去。
馬皇后知道了這件事情，對朱元璋說：“尋常的老百姓給孩子請個老師都恭恭敬敬的，尊敬有加，何況是皇家太子的老師呢？再說了，宋濂先生自告老還鄉以後一直住在鄉下，他又怎麼能知道孫子的事情呢？”朱元璋正在氣頭上，說什麼也不肯饒恕宋濂。吃飯的時候，馬皇后陪著，她呆愣愣地坐在朱元璋旁邊，既不吃菜，也不喝酒，表情呆滯。朱元璋以為皇后病了，就問馬皇后哪兒不舒服，馬皇后難過的說：“宋先生犯了死罪，我十分難受，我在為宋先生祈福呢！”
馬皇后跟朱元璋也是共患難的夫妻，在朱元璋得勢前給了他很大的幫助，朱元璋平常也非常尊重她，兩人的感情非常深。如今聽皇后這麼一說，就下令改判宋濂充軍發配到四川茂州，已經七十多歲的宋濂禁不起旅途勞累又加上擔驚受怕，沒到茂州就與世長辭。
又過了幾年，又有人告發李善長明知道胡惟庸造反卻不舉報，同樣犯了死罪。李善長是明朝開國第一功臣，又是朱元璋的兒女親家。明太祖朱元璋建國封官的時候，賞賜給李善長兩塊免死鐵券，縱然這樣，朱元璋還是把他全家七十多口人全部處死。接著又一次清查胡黨，處死一萬五千多人。
涼國公藍玉同樣是功勳卓著，公元1393年，藍玉被告謀反，朱元璋把他和全家也殺了，受株連的有一萬多人。
胡藍案使得大明朝的開國功臣幾乎屠戮殆盡。德慶侯廖永忠、小明王韓林兒、十王李文忠、元帥徐達、軍師劉伯溫先後死於非命。
在單田芳老師的評書《明英烈》和《燕王掃北》中，朱元璋用白馬汗害死徐達、逼走劉伯溫、炮打慶功樓、把他的結拜大哥武殿章、親家寧伯彪、大將傅友德、丁德興、外甥李文忠金瓜擊頂。
朱元璋如此屠戮功臣，實屬千古未有！
