此時的種子內部生理活動微弱，含水量少，發育充實，最宜貯存。若採收過早，胚發育不完全，貯藏養分不足，曬乾後種仁乾癟，發芽率低，即使發芽出苗，生活力弱，也難成壯苗。一般在9月底成熟，作種子的應比商品核桃晚收3～5天，特別是核桃種子的成熟度對種子的發芽率影響較大。
實踐表明，9月底採的發芽率能達80％左右，9月中旬則為60％～70％，9月上旬只達20％～30％。C核桃種子無後熟期，秋播的種子在採收後1個多月就可播種，有的帶青皮播種，晾曬也不需乾透。而春播的種子貯藏時間則較長。
多數地區以春播為主，貯藏時應注意保持低溫（5℃左右）、低溼（空氣相對溼度50％～60％）和適當通氣，以保證種子經貯藏後仍有正常的生活力。核桃種子的貯藏方法主要是室內幹藏法，其中分普通幹藏法和密封幹藏法2種。前者是將秋採的乾燥種子裝入袋、缸等容器內，放在經過消毒的低溫、乾燥、通風的室內或地窖內。
種子少時可以袋裝吊在屋內，既防鼠害，又可通風散熱。種子如需過夏貯藏時要用密封幹藏法，即將種子裝入雙層塑膠袋內，並放入乾燥劑密封，然後放進可控溫、控溼、通風的種子庫或貯藏室內除室內幹藏法外，也可採用室外溼沙貯藏法。即選擇排水良好、背風向陽、無鼠害的地方，挖貯藏坑，一般坑深0。7～1米、寬1～1。5米，長依種子量而定。
貯藏前，種子應進行水（或鹽水）選擇，將漂浮於水上種仁不飽滿的種子棄除，將浸泡2～3天的飽滿種子取出，沙藏。先在坑底鋪一層溼沙（手握團不滴水為度），厚約10釐米，其上放一層核桃，然後用溼沙填空隙，厚約10釐米，依次分層鋪放，直到距坑口20釐米處，再用溼沙覆蓋與坑口取平，上面用土培成屋脊形，同時於貯藏坑四周開出排水溝，以免積水侵入坑內，造成種子黴爛。
