多年來章、韓遂一直禍害涼州，而董卓次次討伐都沒有成功，東漢政權對於董卓這樣無功的行為表示不滿，於是派司空張溫行使車騎將軍權利，西征繼續討伐叛軍。張溫要求東漢政權支安排孫堅參加這次討伐行動。
軍隊駐紮在長安。張溫以詔書傳召董卓，董卓過了許久才來覲見。張溫譴責，董卓卻口出狂言頂嘴。孫堅看不下去了，跟張溫小小聲的說：“董卓這傢伙狂妄自大，犯了錯還頂嘴，應該按應召之罪就地正法。“
“董卓在隴、蜀一帶就有“健俠”威名，現在殺掉他，此次西進討伐依靠誰呢？”
司空你親自帶領皇家軍隊，武威震動世界，還要靠董卓？看看董卓今天的言論態度，顯得粗魯無禮，根本不想聽你的命令，這是一種罪過；邊章、韓遂為非作歹歷時超過一年，應該及時摧毀，董卓說他不應該隨意進軍，士氣低落，迷惑軍隊，這兩種罪行；身負重任，卻沒有任何功勳，此三罪！。古代的名將每逢帶兵對陣之時，都是就地正法違反軍紀的人，以促進軍法的威嚴。在古代，有例子穰苴斬莊賈， 魏絳殺楊幹。現在，如果你不立即殺死這個傢伙，必然會對軍隊造成傷害。“
張溫覺得董卓是個人才。他不忍心執行軍法。他說：“你暫時返回營地，以免董卓懷疑你。”孫堅不得不起身離開。
次年，張溫破北宮伯玉於美陽，派遣周慎追擊，包圍榆中；又派遣董卓討伐先零羌，打的不理想。張溫被招回京覆命，而孫堅官拜議郎。
中平四年，零陵人區星在長沙發動叛亂，自封為將軍，叛軍發展到萬餘人，圍周朝、郭石也率領叛軍於零陵、桂陽起兵，與區星遙相呼應。東漢政權這時候任命三十三歲的孫堅為長沙太守，他到任之後，選擇有才能的人，並且是內心善良的人就職，於是郡中上下都心服口服。
長沙的治理有了很大改善。擅長用軍事解決問題的孫堅親自帶領朱治等人員襲擊叛亂分子。一個月之內，他消滅了長沙市三縣、零陵叛亂分子。因為這件事辦得漂亮，東漢政權經過調查。根據孫堅過去的功勞，封孫堅為烏程侯。
宜春這時候也被叛軍圍困，太守派人冒死向孫堅請求救援，孫堅很快率領軍隊，為救援做準備。他的主簿進諫說：跨界征討賊兵是違反大漢律法的，我們應該不出兵的好。”。”我作為太守沒有多大的文治德行，只得以武力征伐建功立業，由長沙郡越界至豫章郡宜春縣攻討，以保全郡國。如果因為這件事被朝廷降罪，在四海之內也沒有任何慚愧的？”接著他向宜春縣揮師而進，聽到這個訊息的叛軍隨即逃走了。叛軍聽到這個訊息嚇得直接逃跑了。
當孫堅36歲時，靈帝去世，董卓控制著東漢政權，越過洛陽。孫堅嘆了口氣，說道：“如果張公聽取我的建議，就沒有如今現在這樣了，真是可惜了。”
這時候，各路諸侯紛紛起兵，共同組成了一個與董卓鬥爭的聯盟。
孫堅也率領著豫州各郡兵馬進軍洛陽，不久做了兩件大事：兵到荊州，逼死荊州刺史王睿；兵到南陽，殺掉南陽太守張諮。
王睿曾經和孫堅一起解決了零陵、桂陽的叛亂。那個時候他看見孫堅是武官，眼裡透露出看不起的眼神，。出於這個原因，孫堅也心裡不舒服。王睿與武陵太守曹寅合不來，趁討伐董卓機會，宣稱要殺曹寅。曹寅便假冒光祿大夫溫毅的檄文，歷數王睿的罪過，命令孫堅將他處死，這正是孫堅求之不得的事。
不日後，王睿聽說有軍隊來鬧事，登上城樓觀察，派人詢問這些大兵哥的意圖。
答：“我們長久奔波。風餐露宿，勞苦不堪，賞賜還不夠做衣服呢！想請您開恩，再賞些財物。”
王睿信以為真：“沒有任何問題，我不會吝嗇財物（拿了東西就快滾吧）。”傳令開啟庫房，讓兵士自己進去取用。
兵湧到樓下，王睿發現了孫堅。
問：“士兵們來請求賞賜，孫府君怎麼也在這裡？”
答：“奉案行使者檄文，特來取你的首級。”
又問：“我犯了什麼罪？”
答：“我也不知道！”
王睿走投無路，刮金合著美酒飲之而死。
後來，孫堅帶領軍隊前往南陽，下一份官方檔案要求向南陽太守張諮供應軍糧。此時，孫堅已有數萬人。袁術上表奏請以孫堅為假中郎將。張諮認為，孫堅和自己官職一樣平級，所以對孫堅的要求不理睬。
孫堅帶著牛酒禮物拜訪了張諮，張諮只在第二天感謝。孫堅舉行晚宴來招待張諮，酒過三巡後，孫堅的主簿稟報：“前有文書傳給南陽太守，但至今道路未修，錢糧也未備足，請逮捕他交付問個明白。”“
張諮看情況不妙，想馬上走人，但士兵們都圍在了身邊，沒有辦法走。
不久，主簿又向孫堅請示：“南陽太守稽停義兵，使賊不被討伐，請按軍法從事。”
孫堅便令部下將張諮推出軍門斬首。南陽官員大為震驚。從此，孫堅的部隊在路過的郡縣想要什麼，就有什麼。
董卓的將軍徐榮、李蒙擄掠在梁城遇到孫堅軍。兩邊列開陣勢廝殺，涼州軍多年來的戰鬥經驗不是白給的，明顯素質高過許多，戰爭處於單方面碾壓狀態，徐榮輕鬆愉快的幾乎全殲孫堅的軍隊。孫堅帶著數十個騎兵逃出，而涼州騎兵在後緊追不捨。見事情緊急，孫堅命令親信祖茂戴上自己的紅頭巾。如此，董卓的騎兵改而追擊祖茂了，孫堅才從旁道逃過一劫。但祖茂也很聰明，他跑到荒郊的墳崗，把紅頭巾掛在燒柱之上，自己躲在草叢之中。董卓軍以為要立大功了，裡裡外外圍了數重，等靠近一看，只有個頭巾，以為孫堅等都逃脫了，就撤走了，祖茂也逃過一劫。
孫堅逃回後，一路收集散兵，並以陽人為根據地招兵買馬，軍隊很快就恢復起來了。
董卓聽說孫堅進佔陽人，派胡軫為大都護、呂布為騎督前往迎擊。胡軫這個人性急，面對軍隊紀律渙散，不聽招呼到處燒殺搶掠禍害地方的行為很是生氣。出兵前就揚言：“這次去，我定當斬一青綬（校級官員），部隊才會守紀律。”諸將聽了這話，心中難免生起牴觸情緒。而呂布更是聽在耳裡，恨從心中生：X你娘，難道你一個涼州人要拿我們幷州弟兄動刀，看我不好好的把你弄舒服，灑家就不姓呂。
部隊到達廣城，離陽人還有幾十裡，而天色已晚，車馬勞頓，董卓預先制定的作戰計劃，也要求在廣城住宿，養精蓄銳後再乘夜進兵，天明時攻城。但諸將都不想胡軫成功（一出門就威脅我們，要是贏了不是要上天）。
呂布等人對胡軫說：“陽人城中的敵兵已經逃跑，快點去追趕尋求戰機。否則，機會就沒有了。”
覺得很有道理的胡軫便率軍連夜進發到陽人城下。
但城中守備森嚴，依靠單純的偷襲根本無法成功。
時至深夜，胡軫軍又沒吃飯有沒睡覺，士氣低落。在沒有挖掘塹壕的情況下，軍士們剛解甲休息，呂布又令人四處傳佈謠言：孫堅夜襲了。
黑夜中，軍士們丟盔棄甲，四散奔逃。
孫堅時刻注意到敵方的動靜，見有機可乘，乘勢率領軍隊出城追擊，胡軫全軍潰敗，部下督華雄也被斬殺（死於亂軍中，不是關二哥殺的）。
孫堅此役後，名望大起。
