益生菌和人體健康的話題是沒有止境的，這也意味著益生菌市場的未來無限廣闊，而且不僅僅只是針對人類。
“隨著超級菌團的出現，人類感染到某一天真的可能會無藥可救。”在全國微生物毒素與創傷感染學術會議暨第八屆膿毒症高峰論壇上，中國工程院院士盛志勇呼籲，創傷感染防治的當務之急，是研究並推廣新的方法以取代抗生素。對此，盛志勇進一步指出，隨著我國“以菌治菌”研究初見效，益生菌有望替代抗生素。
一、出現如下情況之一，就應儘快補充益生菌。
1、服用抗生素時，尤其是廣譜抗生素不能識別有害菌和有益菌，所以它殺死有害菌的同時也把有益菌殺死了。打針後兩個小時補充適量益生菌，都會對維持腸道菌群的平衡起到很好的作用。
2、剖腹產、新生兒黃疸和非母乳餵養的嬰兒不能從媽媽那兒得到足夠的益生菌，保護健康的腸道菌膜若不健全，可能會出現食慾不振、體質較弱、大便乾燥等現象，也應該補充適量益生菌。
3、消化不良、大便乾燥、急慢性腹瀉、溼疹、過敏、乳糖不耐受症及吸收功能不好時，益生菌可以透過減少腸壁“孔洞”形成，從根本上解決問題。
4、對於免疫力低下或者需要增強免疫力的，有備無患。
5、帶小兒出行或旅遊時帶點益生菌製劑，如果小兒腸胃不舒服，服用後能夠有效緩解。
二、
如何有效補充益生菌？
1、孕婦在孕期的第三個月開始新增含有益生元的膳食補充劑，刺激雙歧桿菌等有益菌群生長， 調節腸內微生態平衡，增強孕期的免疫力，有效預防孕期便秘；也有利於預防寶寶出生後常見的疾病，可以促進新生兒出生後腸道正常菌群的建立，有助於寶寶較快建立免疫防禦系統。嬰兒免疫系統的2/3來自腸道。
2、對乳糖不耐受的寶寶，因缺乏乳糖酶，不能分解牛奶中的乳糖，飲用牛奶後，常會出現腸鳴、腹脹、腹痛、排氣、吐奶、腹瀉、便秘等，然而服用益生菌可以緩解乳糖不耐受，配方中的雙歧桿菌可以產生乳糖酶，幫助寶寶消化乳糖，緩解腹瀉腹脹等不適。
3、抗生素治療結束後一兩週內，至少要繼續攝入益生菌。因為在治療結束後，身體的免疫力還比較弱。要治療某種疾病，每天大概需要攝入200億～300億個菌落形成單位的益生菌。這個劑量同樣也得到了臨床研究的支援。例如：在波蘭開展的一項研究中，科學家們讓因急性感染性腹瀉住院治療的兒童每天攝入240億個菌落形成單位的益生菌。結果表明，這個劑量的益生菌明顯縮短了他們的病程，而且沒有出現任何副作用。
