吳三桂的兵馬並沒有清朝的兩倍，吳三桂起兵前，手下不過3萬多人馬，起兵時又擴充了一些，也不會太多。吳三桂雖然攻克湖南等地，飲馬長江，但是後方並不穩固。
三藩裡尚可喜並沒有和吳三桂一起起兵，長期據守廣州，牽制了吳三桂不少兵馬。直到吳三桂起兵兩年後，尚可喜子尚之信也造反，逼死尚可喜以後，廣東才算平定。而耿精忠雖然也開始和吳三桂一起起兵，但是一直被臺灣鄭經牽制，其他各地響應起兵的也大多蛇鼠兩端，只顧自己利益，並不服從吳三桂。
吳三桂之所以落敗，原因有以下幾點：
一，貽誤了最佳戰機。起兵之後沒有疾行渡江，全師向北，以軍事勝利推動政治成功；也沒有下金陵，扼長江，絕南北通道，建立鞏固的後方，而是爭奪一些戰略價值不高的城鎮，貽誤了戰機，給了康熙反擊的時間。
二，社會主要矛盾已不是民族矛盾。吳三桂自己先叛明降清，還對各地抗清義軍殘酷鎮壓，當時的民眾都已對其失望至極，一支只為一己私利而戰的軍隊，自然得不到社會主流的支援。
三，康熙的年輕有為。用反間計使政治上平南和靖南二藩孤立吳三桂。用釜底抽薪計安頓其部下的家屬親人，蓋不受株連，瓦解其部下。用誅心計把吳三桂之子吳應熊處死了，直接叫吳三桂心生絕望。
所以吳三桂實際能指揮的兵力很有限，控制的地盤也侷限一隅，加上他自己年事已高，打到長江時已經是強弩之末。清軍初期雖然失利，但是畢竟所佔地域廣闊，進入相持階段以後就不是吳三桂能打敗的了。具有諷刺意味的是，雖然當年吳三桂在山海關時被清軍壓著打，不過入關不過幾十年，八旗軍也已經糜爛不堪，優勢兵力的清軍居然畏懼吳三桂的威名不敢進攻，直到吳三桂死後才敢進軍。真不知道皇太極、多爾袞地下有知會作何感想。
綜上，吳三桂哪有不敗之理，不得人心者又如何能得天下？
