目前全球有13億人吸菸可以影響的藥物包括麻醉藥、止痛藥、解熱鎮痛藥、利尿藥、胃黏膜保護藥、抗酸藥、抗心絞痛藥等。基礎的影響藥效原理為，菸鹼促進肝臟酶活性，對藥物降解水平起抑制作用，讓血液中藥物濃度減低，對胃內消化物排空速度減慢，間接降低藥物吸收速度。
患有腸胃性疾病者，吸菸足以使腸胃病更惡化。患有胃潰瘍或十二指腸潰瘍者，潰瘍處的癒合會減慢，甚至演變為慢性病。
吸菸能刺激神經系統，加速唾液及胃液的分泌，使胃腸時常出現緊張狀態，導致吸菸者食慾不振。另外，尼古丁會使胃腸黏膜的血管收縮，亦令食慾減退。
菸草中含有的許多對人體有害的物質，需要在肝臟中解毒。因此，吸菸使肝臟的負擔加重，影響肝臟的功能。
吸菸會引發多種腦部疾病，會減低迴圈腦部之氧氣及血液，引致腦部血管出血及閉塞，而導致麻痺、智力衰退及中風。中風原因是吸菸導致腦部血管痙攣，使血液比較容易凝結。吸菸者中風機率較非吸菸人士高出兩倍。
吸菸可能會引致肺癌。90%的總死亡率是由吸菸所導致。一個人每天吸食十支菸，其患病率是非吸菸人士之十倍。吸菸亦會引致肺氣腫，肺部支氣管內積聚之有毒物質，會阻礙人體吸入之空氣正常撥出，令肺部細胞膨脹或爆裂，導致患病者呼吸困難。重度肺氣腫患者是十分痛苦的，為了吸入足夠的氧氣，他們不得不上體直立且高頻率地喘息，即使在平地上他們也必須慢慢地行走。有些更嚴重的患者則必須依靠氧氣袋才能維持生命，他們在有生之年必須集中全部的努力去做一個簡單的動作——喘氣。
吸菸對脊髓的神經中樞起抑制作用，吸菸男人性慾變弱，又由於吸菸能使血管收縮、痙攣，引起末梢血迴圈障礙。因此，吸菸是導致陽痿的最主要原因。澳洲和加拿大已在香菸盒上直截了當地印上這個資訊。另外，吸菸可影響精子的活力，使畸形精子增多，停止吸菸三至六個月後，方可恢復正常。如想要一個聰明、健康的孩子，嬰兒專家提倡一定要停止吸菸三到六個月。
當然吸菸也有一些所謂的“好處”
在你熬夜加班或做某些事情的時候，感覺有些疲勞時，抽菸可以讓你暫時的提起精神。
抽菸與抽菸的朋友在見面時，遞上一根菸，可以拉近彼此間的距離，在談生意見客戶的時候，如果對方吸菸，遞上一支香菸，能拉近感情，容易相互溝通，也好辦事。
在遇到一些事情，情緒低落的時候，抽菸可以放鬆一下心情。
在你一個人獨處時，吸菸可以排除寂寞，消磨一下時間。
當你處於緊張或是異常興奮甚至發脾氣暴跳如雷的時候，吸上一支菸，可以減輕緊張感或許能平復一下情緒，從而起到“鎮定劑”的作用。
吸菸也可能會給一些人帶來創作靈感。
