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學術圖表是科研結果最直觀以及最有效的展現方式,直接支撐科研結論,在學術論文、報告、基金申請和結題報告中具有極其重要的作用。學術圖表的一個重要特徵是具有“
自明性
”,
意思是讀者只通過閱讀圖表就能夠迅速讀懂圖表的意思,而不需要去反覆翻閱文稿
。
因此,為了更好地呈現科研結果,科研工作者需要精心設計與繪製學術圖表。
(a) (b)
圖1 論文中的圖片(來自圖源文獻1-2)
學術圖表分為學術圖片(圖1)和學術表格(圖2),學術表格(table)在形式上比較簡單,而且
幾乎所有的學術期刊都要求三線表
(three-line table)
。
三線表以其形式簡潔、功能分明、閱讀方便而在科技論文中被推薦使用。三線表的組成要素包括:
表序、表題、專案欄、表體、表注
(圖2)。
表序和表題放在表格頂部,表注放在表格底部
;這點與圖片不一樣,圖片的圖序、標題和圖注都在圖片底部。表注一般要求使用簡潔明瞭的文字,描述表格的目的、統計方法、標註符號以及所反映的結果,使得表格具有“自明性”的特點。
三線表通常只有3條線,即
頂線、底線和欄目線,表格兩端及內部一般都沒有豎線和斜線。
為了美觀起見,有些期刊會將頂線和底線設定為粗線,欄目線為細線;也可能三條線一樣粗細。
但是三線表並不一定只有3條線,必要時可以新增輔助線
,比如在專案欄裡面新增水平線作為二級分類,在表體裡面新增水平線區分子表格,但無論加多少條輔助線,仍稱做三線表。
圖2 標準三線表(來自圖源文獻3)
學術圖片的種類和獲取方式比較複雜,根據其產生來源大概可以分為成像圖、資料圖和示意圖三種類型(圖3)。
圖3 科研圖片分類及處理示意圖
1、成像圖(Image):
使用成像裝置採集目標物件的光訊號所生成的圖片,如相機、成像系統、顯微鏡、掃描器等拍攝的照片。這類圖片往往需要使用其他軟體如Photoshop等進行剪裁、大小和對比度調整等簡單操作,才能成為規範的科研用圖。要求在採集影象的時候儘可能採集高畫質(高解析度)、無損的圖片,並且注意記錄採集時間、採集條件、採集裝置等元資料(原始資料)。
一般要求儲存成*.tiif格式。
2、資料圖(Data Graphic):
將科研過程中產生的資料,進行合理的統計分析,最後視覺化呈現資料中的規律的圖片。主要包括軟體繪製的各種點狀圖、柱狀圖、箱線圖、生存曲線等等,處理的軟體有Graphpad Prism、Origin、R語言、Python、Excel等。
生成的圖片要儲存成高解析度的*.tif格式或者*.eps等向量格式,以備後續使用,同時注意儲存原始資料。
需要注意的是,
也
可以對成像圖的畫素進行量化,轉變為資料,然後生成資料圖
,生命科學領域最為常見的如Western Blot電泳圖量化後生成的柱狀圖,常用軟體有Image J 、Image Pro Plus和Photoshop等。
3、示意圖(Illustration):
將科研構思透過繪製的方式形象地展現出來。常見的有流程圖、訊號通路圖、機制圖等,常用的軟體有Adobe illustrator、C4D、3dmax等,
比較講究繪圖技巧
。
俗話說“
一圖勝千言(A picture worth a thousand words (of explanation))
”,這句話用在科研領域更是如此。比起學術表格,一張規範、準確、簡潔的圖片能夠更好地向世人呈現作者的研究成果。
甚至在大多數審稿人那裡,在評審一篇論文的時候,通常是先看摘要,大致看一看論文的結構,然後重點放在論文的圖片上面。如果論文的圖片出彩,審稿人的印象也會非常好,對論文的錄用與否具有關鍵作用。
所以,
高質量的論文圖片極其重要
。
圖源文獻:
[1]Wiel Clotilde,Le Gal Kristell,Ibrahim Mohamed X et al。 BACH1 Stabilization by Antioxidants Stimulates Lung Cancer Metastasis。[J] 。Cell, 2019, 178: 330-345。e22。
[2]Kiyozumi Daiji,Noda Taichi,Yamaguchi Ryo et al。 NELL2-mediated lumicrine signaling through OVCH2 is required for male fertility。[J] 。Science, 2020, 368: 1132-1135。
[3]Botvinik-Nezer Rotem,Holzmeister Felix,Camerer Colin F et al。 Variability in the analysis of a single neuroimaging dataset by many teams。[J] 。Nature, 2020, 582: 84-88。
以上內容其實原來計劃放在《Graphpad Prism學術圖表》裡面,加上其他內容有將近兩萬字。後來由於書本篇幅和內容相關性的限制,還是刪掉沒放了,這裡暫時放在公眾號裡面,形成一個關於
學術圖表
基本
規範
的系列吧。
新書上市
張老溼的新書《Graphpad Prism學術圖表》已經上線,這應該是市面上唯一一本系統介紹Graphpad Prism 9軟體使用的書籍,講述了超過50種學術圖表的繪製方法,提供59個繪圖原始檔下載,全面展現了學術圖表的繪製和美化過程,有需要的同學可以購買哦。
Graphpad Prism系列教程
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16、本文
【Parts of whole資料表】:
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