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魚腮一般是硬骨魚類的呼吸器官，長在咽腔的兩側，附著在兩端與腮蓋相連的腮耙之上。從魚腮的構成來看，魚腮腔兩側各有2個腮，每個腮分佈著兩排腮片，腮片之上長有排列整齊的腮絲，腮絲與腮片完美地契合在一起。魚在水中時，透過嘴巴的張開，腮蓋緊閉，口腔容積增大，外部水的壓力大於魚體內的壓力，水被壓入腮腔，此時每個鰓片、鰓絲都完全張開，魚腮與水的接觸面積加大，從而攝取水中溶解氧的機率提升，被鰓絲中的微血管吸收，氧氣隨著血液迴圈被輸送到身體的各個部分，同時把代謝產物排入水中，完成氣體交換。
魚生活在水中，它與其他動物一樣都需要氧氣，而它的氧氣就來源於水中的氧氣，也就是溶解氧。在呼吸時，魚透過將腮部的腮絲全部展開增加與水的接觸面積，從而增加溶解氧的獲取量，以滿足身體對氧氣的需求，這就是魚的呼吸。魚在水中呼吸時腮絲是全部開啟的，這樣能夠增加與水的接觸面積，幫助吸收更多的氧氣。但是，一旦離開水後，由於腮部缺水造成腮絲黏連無法正常開啟，這樣反而不利於魚的呼吸。所以，慢慢的魚就會缺氧而死。
魚用鰓呼吸，鰓絲表面含有豐富的毛細血管，水中的溶解氧此進行氣體交換，魚可以很容易地吸收水中的溶解氧氣，將二氧化碳透過鰓排出。因此魚必須不斷地讓水流過鰓，才能獲得所需的氧氣，如果離開了水，魚將無法呼吸，會缺氧而死。有鰓的同時還有肺，能夠在空氣和水中呼吸。肺魚的肺較為原始，有一個單獨的肺迴圈，使得肺魚能夠在乾旱季節完全沒有水的地方呼吸生存。
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